ВВЕДЕНИЕ…………………………………………………………………5 ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ………………………………..………7 1.1. Значение для человека и история исследования вируса Variola Vera…………………………………………………………………………..…….7 1.2. Особенности программного анализа вирусного генома…………..16 1.3. Описание программы BioEdit……………………………...………..23 ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ…………..26 2.1. Особенности структуры генома вируса Variola Vera и общая характеристика штаммов……………………………………………………….26 2.2. Методы программного анализа……………………..………………31 ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ…………………………..33 ВЫВОДЫ………………………………………….………………………64 СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ………………………………………..…….…65 Приложение ………………………………..……………………………..74

Программный и смысловой анализ различий полногеномных последовательсностей штаммов вируса Variola vera.

дипломная работа
Биология
70 страниц
93% уникальность
2018 год
98 просмотров
Серова Е.
Эксперт по предмету «Биотехнология»
Узнать стоимость консультации
Это бесплатно и займет 1 минуту
Оглавление
Введение
Заключение
Список литературы
ВВЕДЕНИЕ…………………………………………………………………5 ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ………………………………..………7 1.1. Значение для человека и история исследования вируса Variola Vera…………………………………………………………………………..…….7 1.2. Особенности программного анализа вирусного генома…………..16 1.3. Описание программы BioEdit……………………………...………..23 ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ…………..26 2.1. Особенности структуры генома вируса Variola Vera и общая характеристика штаммов……………………………………………………….26 2.2. Методы программного анализа……………………..………………31 ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ…………………………..33 ВЫВОДЫ………………………………………….………………………64 СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ………………………………………..…….…65 Приложение ………………………………..……………………………..74
Читать дальше
Поксовирусы (семейство Poxviridae) представляют собой семейство двухцепочечных ДНК (dsDNA) вирусов большими геномами, длиной 130-360 килобаз, обычно кодирующих более 150 генов на геном. Poxviridae разделены на два подсемейства: 1. Entomopoxvirinae – поражают насекомых; 2. Chordopoxvirinae – поражают позвоночных. Несколько видов в семье поксовируса заражают людей и их домашних животных, в первую очередь представителем данной группы является вирус Variola (VARV), возбудитель оспы, для которого люди являются единственным известным природным хозяином. Этот вирусный патоген был распространен в человеческой популяции на протяжении многих веков и вызывал повторные широкомасштабные эпидемии с большим количеством как выздоровевших, так и умерших больных. В XVIII веке оспа была причиной смерти более 400 тыс. человек в Европе каждый год.


Заказывайте написание контрольной работы по обществознанию. Рассчет стоимости работы бесплатно!


. В конце 20-го, вирус натуральной оспы был полностью искоренен из сообщества людей благодаря массовой вакцинации. На данный момент, созданы репозитории штаммов вируса натуральной оспы и нуклеиновых кислот в двух Сотрудничающих центрах ВОЗ в России и США. Помимо этого, создана открытая база данных, содержащая информацию о структуре геномов различных штаммов натуральной оспы, что позволило продолжить активное изучение филогенеза и процесса эволюционного развития данного патогена. Изучение структуры генома различных штаммов вируса Variola vera стало мощным стимулирующим фактором для развития молекулярной биологии, биоинформатики, генетики и ряда других дисциплин. В настоящее время, продолжается изучение и анализ генетического материала данной группы вирусов, с целью изучения мутационных процессов, происходящих с геномом вирусов, оценки потенциального риска мутации с последующей сменой основного хозяина и эволюционного потенциала других представителей поксовирусов. Цель – провести программный анализ и аннотацию последовательностей ДНК вируса Variola vera. Задачи: • Изучить историю исследования и значение вируса Variola Vera; • Изучить принципы работы и особенности программного анализа вирусов в программе BioEdit; • Провести анализ структуры геномов, определить филогенетическую связь и варианты мутационных изменений 44 штаммов вируса натуральной оспы.

Читать дальше
1. Геномы штаммов Variola Vera состоят из вариабельных концевых областей и консолидированной центральной части генома. Центральная область генома имеет протяженность 1565-188195 п.о. Доля консолидированного участка - 96,9%. 2. Мутации геномов вируса натуральной оспы представлены точечными мутациями, по типу «вставки», «делеции», «транслокации»; делециями размером от 3 п.о. до 30 п.о.; вставками продолжительностью от 6 п.о. до 28 п.о. 3. Точечные мутации отмечаются на протяжении нуклеотидных последовательностей всех штаммов и не несут в себе фенотипически-значимые последствия для вируса натуральной оспы. 4. Наиболее стабильными штаммами Variola Vera являются GER58_hdlg; SUD47_jub; SUD47_rum. Наиболее вариабельным является штамм BRZ66_gar. 5. Среди исследованных штаммов выделены две филогенетические группы, которые имеют различное происхождение. Первая – от штамма SOM77_1252, включает штаммы SUD47_jub; SUD47_rum; SOM77_ali; ETH72_16. Данная ветвь развития вируса стала тупиковой. Вторая группа произошла от штамма SOM77_1605 и характеризуется наибольшим потенциалом изменчивости. 6. Наименее устойчивые к экзогенным факторам являются следующие штаммы: ND64_vel5, SOM77_1605, SOM77_1252, GER58_hdlg.  
Читать дальше
1. Gubser C. Poxvirus genomes: a phylogenetic analysis. / C. Gubser, S. Hué, P. Kellam, G.L. Smith // J Gen Virol. – 2004. – Vol. 85, N 1. – P. 105-117. 2. Dixon C.W. Immunization against smallpox. / C.W. Dixon // Br J Clin Pract. – 1963. – Vol. 17. – P. 641-648. 3. Jobes D.V. Phylogenetic analysis of 22 complete genomes of the human polyomavirus / D.V. Jobes, S.C. Chima, C.F. Ryschkewitsch, G.L. Stoner // JC virus. J Gen Virol. - 1998 – Vol. 79, N 10. – P. 2491-2498. 4. Fagan B.M. The Oxford Companion to Archaeology / B.M. Fagan, C. Beck // Oxford University Press – 1996 – Vol. 15, N 4 - Р. 126. 5. Li Y. On the origin of smallpox: Correlating variola phylogenics with historical smallpox records. / Y. Li, D.S. Carroll, S.N. Gardner, M.C. Walsh, E.A. Vitalis, I.K. Damon // Proc Natl Acad Sci USA -2007. – Vol. 104, N 40. – P. 15787–15792. 6. Gould E.A. Evolution and dispersal of encephalitic flaviviruses. / E.A. Gould, S.R. Moss, S.L. Turner // Arch Virol Suppl. – 2004. – Vol.12, N 18 – P. 65-84. 7. Littman R.J. The plague of Athens: epidemiology and paleopathology / R.J. Littman // Mt Sinai J Med. - 2009 - Vol. 76, N 5 – P. 456-467. (URL - https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/msj.20137. Дата обращения – 22.03.2018) 8. Hopkins D.R. The Greatest Killer: Smallpox in History. / D.R. Hopkins // University of Chicago Press - 2002. Vol. 34, N 5. – P. 84-89. 9. Lefkowitz E.J. Poxviruses: past, present and future / E.J. Lefkowitz, C. Wang, C. Upton // Virus Res. - 2006 – Vol. 117 – P. 105-118. 10. Liolios K. The Genomes On Line Database (GOLD) v.2: a monitor of genome projects worldwide / K. Liolios, N. Tavernarakis, P. Hugenholtz, N.C. Kyrpides // Nucleic Acids Res. – 2006. – Vol. 34. – P. 332-334. 11. Babkin I.V. A retrospective study of the orthopoxvirus molecular evolution / I.V. Babkin, I.N. Babkina // Infect Genet Evol. – 2012 – Vol. 2 (8) – P. 1597-1604. 12. Bahir I. Viral adaptation to host: a proteome-based analysis of codon usage and amino acid preferences / I. Bahir, M. Fromer, Y. Prat , M. Linial // Mol. Systems Biol. - 2009. - Vol. 5, N 10. - P. 71–88. 13. Быстрова Т.Н. Молекулярно-генетическая характеристика вирусов / Т.Н. Быстрова, Ю.В. Михайлова / Журнал МедиАль. 2014. №2 (12). С.88-102 14. Esteban D.J. Interleukin-18 and glycosaminoglycan binding by a protein encoded by Variola virus. / D.J. Esteban, A.A. Nuara, R.M. Buller // J Gen Virol. - 2004 – Vol. 85, N 5 – P. 1291-1299. 15. Esteban D.J. Genes in the terminal regions of orthopoxvirus genomes experience adaptive molecular evolution / D.J. Esteban, A.P. Hutchinson // BMC Genomics. – 2011 – Vol. 23, N 12 – P. 261 (URL - https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21605412/) 16. Esposito J.J. Genome sequence diversity and clues to the evolution of variola (smallpox) virus. / J.J. Esposito, S.A. Sammons, A.M. Frace, J.D. Osborne, M. Glsen-Rasmussen, M. Zhang, D. Govil, I.K. Damon, R. Kline, M. Laker, Y. Li, G.L. Smith, H. Meyer, J.W. LeDuc, R.M. Wohlhueter // Science. - 2006. – Vol. 313 – P. 807-812. 17. Bruen T. A simple and robust statistical test for detecting the presence of recombination. / T. Bruen, H. Philippe, D. Bryant // Genetics. 2005. – Vol. 172. – P. 2665-2681. 18. Bofkin A. Variation in evolutionary processes at different codon positions. / A. Bofkin, N. Goldman // Mol. Biol. Evol. - 2007. - Vol. 24, N 2. - P. 513–521. 19. Berglund E.C. Computational resources in infectious disease: limitations and challenges. / E.C. Berglund, B. Nystedt, S.G. Andersson / / Plos Computat. Boil. - 2009. – Vol. 5, N 10. - P. 69–80. 20. Brown J.R. Smallpox - a retrospect. / J.R. Brown, D.M. McLean // Can Med Assoc J. – 1962. – Vol. 6, N 87 – P. 765-767. (URL - https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1849642/. Дата обращения – 22.03.2018) 21. Kulkarni-Kale U. Curation of viral genomes: challenges, applications and the way forward / U. Kulkarni-Kale, S.G. Bhosle, G.S. Manjari, M. Joshi, S. Bansode, A.S. Kolaskar // BMC Bioinformatics. - 2006 – Vol.18 N 7. – P. 512 - 520. 22. Shchelkunova S.N. Comparison of the genome DNA sequences of Bangladesh-1975 and India-1967 variola viruses. / S.N. Shchelkunova, R.F. Massungb, J.J. Esposito // Virus Research. – 1995. – Vol. 36, N 1. - P. 107-118 23. Shchelkunov, S. N., Blinov. V. M., Sandakhchiev, L. S. Genes of variola and vaccinia viruses necessary to overcome the host protective mechanisms / S. N. Shchelkunov, V. M. Blinov., L. S. Sandakhchiev //FEBS Lett. – 1993 – Vol. 379. – P. 80-83. 24. Shchelkunov S.N. How long ago did smallpox virus emerge? / S.N. Shchelkunov // Arch Virol. – 2009 – Vol. 154, N 12. – P. 1865-1871 25. Mohamed M.R. Proteomic screening of variola virus reveals a unique NF-kappaB inhibitor that is highly conserved among pathogenic orthopoxviruses / M.R. Mohamed, M.M. Rahman, J.S. Lanchbury, D. Shattuck, C. Neff, M. Dufford, N. van Buuren, K. Fagan, M. Barry, S. Smith, I. Damon, G. McFadden // Proc Natl Acad Sci USA. – 2009 – Vol. 106, N 22. – P 9045-9050. 26. Huson D.H. Application of phylogenetic networks in evolutionary studies / D.H. Huson, D. Bryant // Mol. Biol. Evol. - 2006 – Vol. 23. – P. 254-267. 27. Firth C. Using time-structured data to estimate evolutionary rates of double-stranded DNA viruses / C. Firth, A. Kitchen, B. Shapiro // Mol Biol Evol. - 2010 – Vol. 27 N 9 – P. 2038-2051 28. Babkina I.N. Phylogenetic comparison of the genomes of different strains of variola virus / I.N Babkina, I.V U. Babkin. Le, S. Ropp, R. Kline, I. Damon, J. Esposito, L.S. Sandakhchiev, S.N. Shchelkunov // Dokl Biochem Biophys. – 2004. – Vol. 398 – P. 316-319. 29. Pankhurst R. The Ethiopian Borderlands: Essays in Regional History frоm Ancient Times to the End of the 18th Century / Pankhurst R. // The Red Sea Press. - 1997. – Vol. 5 - Р. 85 30. Piskurek O. Poxviruses as possible vectors for horizontal transfer of retroposons frоm reptiles to mammals / O. Piskurek, N. Okada // Proc Natl Acad Sci USA. - 2007 – Vol. 104, N 29. – P. 12046-12051 31. Tillib S.V. "Camel nanoantibody" is an efficient tool for research, diagnostics and therapy / S.V. Tillib // Mol Biol (Mosk). – 2011. – Vol. 45, N 1. – P. 77-85. 32. Lourie B. Isolation of poxvirus frоm an African Rodent / B. Lourie, J.H. Nakano, G.E. Kemp, H.W. Setzer // J Infect Dis. – 1975. – Vol. 132, N 6. – P. 677-681. 33. Smithson C. Prediction of steps in the evolution of variola virus host range / C. Smithson, A. Purdy, A.J. Verster, C. Upton // PLoS One. – 2014. – Vol. 9, N 3. P.56-72 34. Орловская И.А. Биологические эффекты рекомбинантного белка вируса натуральной оспы, связывающего фактор некроза опухолей / И.А. Орловская, Д.Д. Цырендоржиев, Л.Б. Топоркова, В.В. Курилин, Ю.А. Лопатникова, Е.А. Вязовая, И.П. Гилева, С.Н. Щелкунов, С.В. Сенников // Медицинская иммунология - 2012. - №1. – C. 16 35. Dunlop L.R. Variola virus immune evasion proteins. / L.R. Dunlop, K.A. Oehlberg, J.J. Reid, D. Avci, A.M. Rosengard // Microbes Infect. - 2003 – Vol. 5, N 11 – P. 1049-1056. 36. Van Vliet K. Poxvirus proteomics and virus-host protein interactions / K. Van Vliet, M.R. Mohamed, L. Zhang, N.Y. Villa, S.J. Werden, J. Liu, G. McFadden // Microbiol Mol Biol Rev. – 2009. – Vol. 73, N 4. – P. 730-749. 37. Kaper J.M. Nucleotide sequence predicts circularity and self-cleavage of 300-ribonucleotide satellite of arabis mosaic virus / J.M. Kaper, M.E. Tousignant, G. Steger // Biochem Biophys Res Commun. - 1988 – Vol. 154, N 1 – P. 318-325. 38. Yadav V.N. Identification of hot spots in the variola virus complement inhibitor (SPICE) for human complement regulation / V.N. Yadav, K. Pyaram, J. Mullick, A. Sahu // J Virol. – 2008. – Vol. 82, N 7. – P. 3283-3294 39. Yao X.D., Evans D.H. High-frequency genetic recombination and reactivation of orthopoxviruses frоm DNA fragments transfected into leporipoxvirus-infected cells / X.D. Yao, D.H. Evans // J Virol. – 2003. – Vol. 77, N 13. – P. 7281-7290. 40. Hughes A.L. The evolutionary biology of poxviruses / A.L. Hughes, S. Irausquin, R. Friedman // Infect Genet Evol. - 2010 – Vol. 10, N 1 – P. 50-59. 41. Fagan B.M. The Oxford Companion to Archaeology / B.M. Fagan, C. Beck // Oxford University Press – 1996 – Vol. 15, N 4 - Р. 126. 42. Babkin I.V. A retrospective study of the orthopoxvirus molecular evolution / I.V. Babkin, I.N. Babkina // Infect Genet Evol. – 2012 – Vol. 2 (8) – P. 1597-1604. 43. Bailey T.R. N‐(3,3a,4,4a,5,5a,6,6a‐Octahydro‐1,3‐dioxo‐4,6‐ethenocycloprop[f]isoindol‐2‐(1H)‐yl)carboxamides: identification of novel orthopoxvirus egress inhibitors / T.R. Bailey, S.R. Rippin, E. Opsitnick, C.J. Burns, D.C. Pevear, M.S. Collett, G. Rhodes, S. Tohan, J.W. Huggins, R.O. Baker, E.R. Kern, K.A. Keith, D. Dai, G. Yang, D. Hruby, R. Jordan //. Journal of Medicinal Chemistry – 2007. - Vol 50 – P. 1442–1444. 44. Liu B. Identification of Poxvirus Genome Uncoating and DNA Replication Factors with Mutually Redundant Roles / B. Liu, D. Panda, J.D. Mendez-Rios, S. Ganesan, L.S. Wyatt, B. Moss // J Virol. – 2018. – Vol. 92, N. 7. – P. 16-22 45. Дромашко С.Г. Постгеномные подходы к управлению наследственностью: от секвенирования генома к персонализированной медицине / С.Г. Дромашко / Наука и инновации. 2013. - №125. – С. 12 46. Reddy T.B. The Genomes OnLine Database (GOLD) v.5: a metadata management system based on a four level (meta)genome project classification. / T.B. Reddy, A.D. Thomas, D. Stamatis, J. Bertsch, M. Isbandi, J. Jansson, J. Mallajosyula, I. Pagani, E.A. Lobos, N.C. Kyrpides // Nucleic Acids Res. – 2015. – Vol. 43. – P. 1099-1106. 47. Грушецкая З. Е. Молекулярно-генетическая структура генов их роль в формировании клеточных стенок / З.Е. Грушецкая, В.В. Титок, В.Н. Леонтьев, Д.В. Галиновский, В.А. Лемеш // Труды БГТУ. Серия 2: Химические технологии, биотехнология, геоэкология. - 2008. - №1(4). С. 158-160. 48. Сандырева Т.П. Филогенетический анализ в эпидемиологических расследованиях / Т.П. Сандырева, Н.А. Герасимова, А.Э. Лопатухин, Д.Е. Киреев, Д.А. Куевда, Г.А. Шипулин, А.С. Подымова // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2014. - №1. – С. 17-21. 49. Мартьянов В.И. Обзор приложений логико-эвристических методов решения комбинаторных задач высокой сложности / В.И. Мартьянов, В.В. Архипов, М.Д. Каташевцев, Д.В. Пахомов // Современные технологии. Системный анализ. Моделирование. - 2010. - № 4. - С. 205-211. 50. Джиоев Ю.П. Детекция потенциальных сайтов рекомбинации вируса клещевого энцефалита методами сравнительной геномики / Ю.П. Джиоев, А.И. Парамонов, О.Н. Рева, Ю.С. Букин, И.В. Козлова, Т.В. Демина, С.Е. Ткачев, В.И. Злобин // Вопросы вирусологии. - 2015. - №60 (3). – С. 44-49. 51. Григорьев А.В. Выравнивание двух ДНК последовательностей, оптимальное для реализации на графическом процессоре / А.В. Григорьев // Вестник СГТУ. - 2012. - №2 (64). – С. 12-21 52. Shchelkunov S.N. Alastrim smallpox variola minor virus genome DNA sequences / S.N. Shchelkunov, A.V. Totmenin, V.N. Loparev, P.F. Safronov, V.V. Gutorov, V.E. Chizhikov, J.C. Knight, J.M. Parsons, R.F. Massung, J.J. Esposito // Virology. – 2000. – Vol. 26. – N 2. – P. 361-386. 53. Perry K. Insights frоm the structure of a smallpox virus topoisomerase-DNA transition state mimic / K. Perry, Y. Hwang, F.D. Bushman, G.D. Van Duyne // Structure. – 2010. – Vol. 18. – N 1. – P. 127-137. 54. Afonso C.L. The genome of camelpox virus / C.L. Afonso, E.R. Tulman, Z. Lu, L. Zsak, N.T. Sandybaev, U.Z. Kerembekova, V.L. Zaitsev, G.F. Kutish, D.L. Rock // Virology. – 2002. – Vol. 295, N 1. – P. 1-9. 55. Shchelkunov S.N. The genomic sequence analysis of the left and right species-specific terminal region of a cowpox virus strain reveals unique sequences and a cluster of intact ORFs for immunomodulatory and host range proteins / S.N. Shchelkunov, P.F. Safronov, A.V. Totmenin, N.A. Petrov, O.I. Ryazankina, V.V. Gutorov, G.J. Kotwal // Virology. – 1998. – Vol. 243, N 2. – P. 432-460. 56. Sèle C. Low-resolution structure of vaccinia virus DNA replication machinery / C. Sèle, F. Gabel, I. Gutsche, I. Ivanov, W.P. Burmeister, F. Iseni, N. Tarbouriech // J Virol. – 2013. – Vol. 87, N 3. – P. 1679-1689 57. Porter A.F. Comment: Characterization of Two Historic Smallpox Specimens frоm a Czech Museum / A.F. Porter, A.T. Duggan, H.N. Poinar, E.C. Holmes // Viruses. – 2017. – Vol. 28. – P. 9-10. 58. Smithson C. Re-Assembly and Analysis of an Ancient Variola Virus Genome / C. Smithson, J. Imbery, C. Upton // Viruses. – 2017. – Vol. 8, N 9. – P. 9 59. K.H. Rubins. Stunned Silence: Gene Expression Programs in Human Cells Infected with Monkeypox or Vaccinia Virus / K.H. Rubins, L.E. Hensley, D.A. Relman, P.O. Brown, F.R. DeLeo. // PLoS One. – 2011. – Vol. 6, N. 1. – P. 16-18 60. Sakala I.G. Deficiency in Th2 cytokine responses exacerbate orthopoxvirus infection / I.G. Sakala, G. Chaudhri, P. Eldi, R.M. Buller, G. Karupiah // PLoS One. – 2015. – Vol. 10, N 3. – P. 10-12 61. Damon I.K. Are we there yet? The smallpox research agenda using variola virus / I.K. Damon, C.R. Damaso, G. McFadden // PLoS Pathog. – 2014. – Vol 10, N 5. – 62. Thèves C. The rediscovery of smallpox / C. Thèves, P. Biagini, E. Crubézy // Clin Microbiol Infect. – 2014. – Vol. 20, N 3. – P. 210-218. 63. 56. Tulman E.R. Genome of variola virus / E.R. Tulman, G. Delhon, C.L. Afonso, Z. Lu, L. Zsak, N.T. Sandybaev, U.Z. Kerembekova, V.L. Zaitsev, G.F. Kutish, D.L. Rock // J Virol. – 2006. – Vol. 80, N 18. – P. 9244-9258. 64. Ovsyannikova I.G. Genetic variation in IL18R1 and IL18 genes and Inteferon γ ELISPOT response to smallpox vaccination: an unexpected relationship / I.G. Ovsyannikova, I.H. Haralambieva, R.B. Kennedy, M.M. O'Byrne, V.S. Pankratz, G.A. Poland // J Infect Dis. – 2013. – Vol. 208, N 9. - 1422-1430. 65. Bratke K.A. A survey of host range genes in poxvirus genomes / K.A. Bratke, A. McLysaght, S. Rothenburg // Infect Genet Evol. – 2013. – Vol. 14. – P. 406-425. 66. Medaglia M.L. Genomic Analysis, Phenotype, and Virulence of the Historical Brazilian Smallpox Vaccine Strain IOC: Implications for the Origins and Evolutionary Relationships of Vaccinia Virus / M.L. Medaglia, N. Moussatché, A. Nitsche, P.W. Dabrowski, Y. Li, I.K. Damon, C.G. Lucas, L.B. Arruda, C.R. Damaso // J Virol. – 2015. – Vol. 89, N. 23. P. 11909-11925 67. Marshall B. Variola virus F1L is a Bcl-2-like protein that unlike its vaccinia virus counterpart inhibits apoptosis independent of Bim / B. Marshall, H. Puthalakath, S. Caria, S. Chugh, M. Doerflinger, P.M. Colman, M. Kvansakul // Cell Death Dis. – 2015. – Vol. 12, N. 6. – P. 123 68. Gerlic M. Vaccinia virus F1L protein promotes virulence by inhibiting inflammasome activation / M. Gerlic, B. Faustin, A. Postigo, E.C. Yu, M. Proell, N. Gombosuren, M. Krajewska, R. Flynn, M. Croft, M. Way, A. Satterthwait, R.C. Liddington, S. Salek-Ardakani, S. Matsuzawa, J.C. Reed // Proc Natl Acad Sci U S A. – 2013. – Vol. 110, N. 19. – P. 7808-7813. 69. Volz A. E3L and F1L Gene Functions Modulate the Protective Capacity of Modified Vaccinia Virus Ankara Immunization in Murine Model of Human Smallpox / A. Volz, S. Jany, A. Freudenstein, M. Lantermann, H. Ludwig, G. Sutter // Viruses. – 2018. – Vol. 10, N 1. – P. 82-87 70. Bera B.Ch. Sequence and phylogenetic analysis of host-range (E3L, K3L, and C7L) and structural protein (B5R) genes of buffalopox virus isolates frоm buffalo, cattle, and human in India / B.Ch. Bera, K. Shanmugasundaram, S. Barua, T. Anand, T. Riyesh, R.K. Vaid, N. Virmani, M. Bansal, B.N. Shukla, P. Malik, R.K. Singh // Virus Genes. – 2012. – Vol. 45, N. 3. – P. 488-498. 71. Unterholzner L. The interferon response to intracellular DNA: why so many receptors? / L. Unterholzner //Immunobiology. – 2013. – Vol. 218, N 11. – P. 1312-1321 72. Meng X. Vaccinia virus K3L and C7L inhibit antiviral activities induced by type I interferons / X. Meng, C. Jiang, J. Arsenio, K. Dick, J. Cao, Y. Xiang // J Virol. – 2009. – Vol. 83, N. 20. – P. 10627-10636 73. Koehler H. Inhibition of DAI-dependent necroptosis by the Z-DNA binding domain of the vaccinia virus innate immune evasion protein, E3 / H. Koehler, S. Cotsmire, J. Langland, K.V. Kibler, D. Kalman, J.W. Upton, E.S. Mocarski, B.L. Jacobs // Proc Natl Acad Sci U S A. – 2017. – Vol. 114, N. 43. – P. 11506-11511 74. Buttigieg K. Genetic screen of a library of chimeric poxviruses identifies an ankyrin repeat protein involved in resistance to the avian type I interferon response / K. Buttigieg, S.M. Laidlaw, C. Ross, M. Davies, S. Goodbourn, M.A. Skinner // J Virol. – 2013. – Vol. 87, N. 9. – P. 5028-5040. 75. Haller S.L. Poxviruses and the evolution of host range and virulence / S.L. Haller, C. Peng, G. McFadden, S. Rothenburg // Infect Genet Evol. – 2014. – Vol. 21. – P. 15-40. 76. Smith K.A. Smallpox: can we still learn frоm the journey to eradication? / Smith K.A. // Indian J Med Res. – 2013. – Vol. 137, N. 5. – P. 895-899. 77. Singh R.K. Emergence and reemergence of vaccinia-like viruses: global scenario and perspectives / R.K. Singh, V. Balamurugan, V. Bhanuprakash, G. Venkatesan, M. Hosamani // Indian J Virol. – 2012. – Vol. 23, N. 1. – P. 1-11.  
Читать дальше
Поможем с написанием такой-же работы от 500 р.
Лучшие эксперты сервиса ждут твоего задания

Похожие работы

практическое задание
Анализ журнала "Индекс. Досье на цензуру"
Количество страниц:
4
Оригинальность:
75%
Год сдачи:
2013
Предмет:
История журналистики
курсовая работа
Виды и типы муниципальных газет
Количество страниц:
40
Оригинальность:
93%
Год сдачи:
2021
Предмет:
История журналистики
реферат
На тему: Творческие способности журналиста
Количество страниц:
5
Оригинальность:
56%
Год сдачи:
2019
Предмет:
История журналистики
дипломная работа
"Радио России": история становления, редакционная политика, аудитория. (Имеется в виду радиостанция "Радио России")
Количество страниц:
70
Оригинальность:
61%
Год сдачи:
2015
Предмет:
История журналистики
курсовая работа
26. Центральное (всесоюзное) радиовещание: история создания и развития.
Количество страниц:
25
Оригинальность:
84%
Год сдачи:
2016
Предмет:
История журналистики

Поможем с работой
любого уровня сложности!

Это бесплатно и займет 1 минуту
image